詳しい解説は暇な時に書くとして、とりあえず結論構築を提示します。
ステップ
Google Slideのページ設定から、サイズを2560×1440pxにする
ヘッダーツールバーの「ファイル」の中に「ページ設定」があるので選ぶ。

デフォルトだと「ワイドスクリーン(16:9)」になっているものを「カスタム」にする。その後、単位を「ピクセル」に変えて以下のように設定。

毎回設定するのは面倒なのでテンプレを変えておきましょう。
Google SlideからエクスポートしたPDFを正規化する
qpdfの導入はこちら(Homebrew使用)。
$ brew install qpdf $ qpdf --version qpdf version 12.3.2 Run qpdf --copyright to see copyright and license information.
PDFファイルの正規化は以下のコマンドで実行できる。
$ qpdf --qdf ~/Downloads/Slide.pdf ~/Downloads/Slide_qpdf.pdf
あとはアップロードするだけ
生成されたSlide_qpdf.pdfをSpeakerDeckにアップロード。

ここが1920 × 1080になっていることと、生成された画像に文字化けが発生していないことを確認しよう。